X-Men’in ilk bölümünden itibaren Profesor Xavier’in Yetenekli Gençler Okulu,  Marvel Comics’in en ünlü süper kahraman gruplarının başında gelir. Yetenekli gençler özel yeteneklere sahip olan mutatntlardır. Bu okulun amacı onlara bu yeteneklerini akıllıca ve dünyayı kötülükten korumaya yönelik olarak kullanmalarını öğretmektir. Seri Jean Grey’in (Marvel Girl) okula gelmesi ve zihin okuma yeteneğine sahip olan, ancak tekerlekli sandalyeye mahkum bir şekilde yaşayan Profesör X’in onu karşılamasıyla başlar. Scott Summers(Cyclops), Hank McCoy(The Beast), Warren Worthington(The Angel) ve Bobby Drake(Iceman); Jean Grey’den önce okula gelmişlerdir. Jean Grey’in de okula gelmesiyle ekip tamamlanmıştır. En güçlü ve en kötü mutantlardan oluşan Magneto, bir füze merkezini istila etmiştir. Ekibin ilk görevi Profesör X gibi tekerlekli sandalyeli liderleri olan bu Magneto grubuyla savaşmaktır.

X-Men’in maceraları 1963 yılından 1970’lere kadar sürmüştür. Bu yıllar arasında X-Men’in çizgi romanları çok ünlü çizerler tarafından hazırlanmasına karşın beklenen ilgiyi bir türlü görememiş ve yayından kaldırılmıştır. Beş yıl boyunca eski bölümleri tekrar basılan X-Men’e yeni karakterlerin eklenmesine karar verilmiş ve hikâye kaldığı yerden, eski öğrencilerin mezun olması ve yenilerinin gelmesiyle, devam etmiştir. Okula yeni katılan öğrenciler öncekilerden çok daha yetenekli ve gariptirler. Aralarında canavar görünümlü Nightcrawler, gizemli geçmişi ile okuyucuların ilgisini çekmeyi başaran Wolverine ve doğa olaylarına müdahale edebilen egzotik güzel Storm gibi karakterler vardır. Serüvenler genç çizer Chris Claremont’un hikâyeleri ve çizimleriyle çok daha sürükleyici hale gelmiş, ekip ayrılanlar ve yeni katılanlar sayesinde büyük bir okuyucu kitlesi kazanmıştır. Çok geçmeden X-Men, Marvel’in en çok satan çizgi romanı haline gelmiştir.